وتختص الهيئة بإدارة وتحصيل وتنفيذ الضرائب الاتحادية والغرامات المرتبطة وتوزيع إيراداتها، وتطبيق الإجراءات الضريبية المعمول بها في الدولة. ويكون لها، في سبيل تحقيق ذلك، تطبيق القوانين والأنظمة المعمول بها فيما يخص الضرائب الاتحادية والغرامات المرتبطة، وكذلك سداد ما يترتب على الهيئة من التزامات مالية، وتطبيق اتفاقيات منع الازدواج الضريبي التي تصدق عليها الدولة.
ويكون مقر الهيئة في مدينة أبوظبي. ويجوز، بقرار المجلس، إنشاء فروع ومكاتب لها داخل الدولة. وتشمل اختصاصات الهيئة البت في طلبات التسجيل في الأنظمة المعمول بها في الدولة، وتخصيص أرقام ضريبية للتسجيل في هذه الأنظمة، وكذلك اقتراح التشريعات المتعلقة بإدارة وتحصيل وتنفيذ الضرائب الاتحادية والغرامات المرتبطة وتوزيع الإيرادات، وإنشاء سجلات لدفع الضريبة، وإصدار التوجيهات والتوضيحات اللازمة لدفع الضرائب. ويتولى إدارة الهيئة مجلس إدارة يشكل برئاسة الوزير وعدد كافٍ من الأعضاء، ويكون للهيئة مدير عام بدرجة وكيل وزارة، يعين بمرسوم اتحادي.